En la época Colonial era una mansión residencial del siglo XVII, remodelada posteriormente con tipo arquitectónico estilo republicano. Esta casa se convirtió en el Palacio Episcopal de la Diócesis de Tunja, a partir del año 1939.
La Sección “José Ignacio de Márquez”, también llamada “Sección Integrada”, se encuentra ubicada en la carrera 9 No. 21-32; inició como “Sección Femenina” y fue creada mediante la Resolución No. 10 del 23 de marzo de 1944, por el entonces Rector, Doctor Jorge Cárdenas García. A partir de 1988, se convirtió en la “Sección Integrada”.