El 20 de Octubre de 1822, el Vicepresidente Francisco de Paula Santander instaló oficialmente el Colegio de Boyacá .
Y le asignó como sede el convento de San Agustín, en el lugar donde funciona actualmente la Biblioteca «Alfonso Patiño Roselli», del Banco de la República.
Para el año de 1825 se establecen las Cátedras de Derecho Civil ,Medicina y Derecho Canónico; igualmente se crea la Educación Primaria con el método Lancasteriano en la Educación. En un principio se nombró como Rector el presbítero Dr. José María Ramírez del Fierro, cura de Pueblo Viejo, mediante el Decreto del 5 de septiembre de 1822; pero, este clérigo no aceptó, por lo cual se nombró como Rector en propiedad, al franciscano José Antonio Cháves, quien se constituyó en su primer rector, los siguientes cargos en el organigrama fueron nombrados por el gobierno nacional..
